La Facultad de Filosofía, Humanidades y Artes es el resultado de la fusión entre el Instituto Superior del Profesorado Secundario Domingo F. Sarmiento, el Instituto Superior del Magisterio de la Universidad Provincial D. F. Sarmiento y el Instituto Superior de Artes (ISA). El primero tuvo sus orígenes en el año 1947 como Profesorado Normal de Ciencias y Letras de la Provincia, que en 1958 fue elevado a la categoría de instituto. Por otra parte, el Instituto Superior del Magisterio fue inaugurado el 11 de mayo de 1957 y en 1964, al crearse la Universidad Provincial D. F. Sarmiento, se incorporó a la misma. Finalmente, el ISA surgió de dos talleres-escuela con orientación en música y artes plásticas, que tuvieron sus comienzos en la década del 50, paralelamente con el movimiento cultural que se desarrolló en la provincia.
En 1973, con la creación de la Universidad Nacional de San Juan, la Facultad de Filosofía, Humanidades y Artes quedó conformada por esos tres Institutos y según el espíritu de la Ley 20654, por la Ordenanza 1-1-1974 del 27 de diciembre las Artes fueron unidas a las Humanidades en una misma Facultad.
El 23-10-1975 se deroga esta ordenanza y según Ord. 33 de ese mismo año la Universidad Nacional de San Juan se estructuró en base a cuatro facultades entre ellas la Facultad de Filosofía Humanidades y Artes constituida por las siguientes unidades:
Institutos de Investigación /Centros de Creación Artística y los siguientes departamentos
Filosofía y Pedagogía
Departamento de Lengua y Literatura
Departamento de Historia
Departamento de Enseñanza primaria, diferenciada y especial
